红豆杉使用除草剂一般分为两种用法，一是在杂草萌芽前使用，二是在杂草萌芽后使用，这里主要讲红豆杉基地杂草萌芽后使用的除草剂，下面的除草剂并不仅仅用于红豆杉，一般的园林苗圃地都可以使用。
灭生性除草剂选择性除草剂杂草出芽以后使用，对未长出杂草基本无效（只有个别除草剂品种例外）在杂草旺盛生长期，将对应除草剂按照推荐用量和兑水量均匀喷施于杂草叶片，通过触杀或叶片吸收传导，导致杂草光合作用停止呼吸作用停止破坏杂草生理过程中必需的生物酶等作用，导致杂草死亡。
一、常见灭生性除草剂
1、草甘膦（其它商品名有农达春多多农民乐达利农等）：为内吸传导型广谱灭生性除草剂作茎叶处理，土壤处理无效适用于苗圃步道及园林大树下喷洒，其特点：
杀草谱广：能杀死四十多个科百余种杂草，防除效果最佳的是窄叶杂草(如禾本科莎草科)豆科百合科茶科樟科等一些叶面腊质层厚的植物抗药性较强，对杂竹芒萁骨防除效果极差防除林地白茅五节芒大芒菜蕨效果好，能斩草除根价格低，经济效益显著无环境污染，对土壤里潜藏种子和土壤微生物无影响要定向喷在杂草上，否则易产生药害，不适宜在红豆杉小苗苗床喷洒可混合性强，能与盖草能果尔等土壤处理除草剂混用，除灭草外，还能预防杂草危害主要弱点：单用入土后对未萌发杂草无预防作用常见剂型有水剂可溶性粉剂等
2、草胺膦（草丁膦），为内吸传导型广谱灭生性红豆杉除草剂作茎叶处理，土壤处理无效用于果园葡萄园非耕地除草，防除森林和高山牧场的悬钩子和蕨类植物
3、百草枯（克无踪对草快龙卷风）为速效触杀型广谱灭生性除草剂作茎叶处理，土壤处理无效能杀死大部分禾本科和阔叶杂草，只对绿色组织起作用见效快，施药半小时就能被杂草吸收，半小时后下雨不受影响，见效快，一天黄三天死但只能杀死地上部分，不能杀死地下部分，几天后新草又长出
二、选择性除草剂
1、环嗪酮（森草净草灌净森泰威尔柏林草净），选择性内吸传导性广谱高效林地除草剂，属均三氮苯类具有芽前芽后除草活性可杀草，也能抑制种子萌发，用药量少，杀草谱广，持效期长，用药一次，可保持1－2年内基本无草植物根叶都能吸收，主要通过木质部传导，对针叶树（松柏树等）根部没有伤害，是优良的林用除草剂药效进程较慢，杂草1个月，灌木2个月，乔木3-10个月对人畜低毒适用于常绿针叶林，如红豆杉红松樟子松云杉马尾松等幼林抚育造林前除草灭灌维护森林防火线及林分改造等，可防除大部分单子叶和双子叶杂草及木本植物黄花忍冬珍珠梅榛子柳叶绣线菊刺五加山杨木桦椴水曲柳黄波罗核桃揪等
2、圃草净，适用于多种木本及移栽苗圃草花类及木本扦插苗圃禁用对金森女贞毒害大防除绝大多数5叶以下（杂草株高约在10公分以下）的禾本科杂草阔叶杂草及莎草科杂草5叶以上杂草效果差木质化杂草无效作定向喷雾茎叶处理对杂草叶片进行均匀喷雾尽量不要喷到苗木幼嫩叶片上用药后24小时内杂草停止生长，7 -10天内杂草开始变黄枯萎，10-15天死亡圃草净A瓶用于防除多种禾本科杂草，防除狗牙根茅草时每亩需增加1倍用药量；圃草净B瓶用于防除5叶以下的多种阔叶杂草莎草科杂草防除禾本科杂草阔叶杂草及莎草科杂草，将A瓶B瓶结合使用尽量不要喷到红豆杉树苗木叶片上喷到幼嫩叶片上后会有短期叶片发黄或短期停止生长现象，追肥浇水后15天内恢复正常生长如发黄严重，可以喷施赤霉素（920）或芸苔素内酯速生根掺加尿素50克/喷壶解毒，7天一次，连续两次
另据报道，日本发明了一种水溶性颗粒剂型的广谱性红豆杉除草剂BGX816，以5公斤／公顷的浓度在大田果园种植园和稻田中使用，用药后3天可以杀死一年生杂草达18种，对于多年生扩叶杂草每公顷使用6公斤即可明显杀死，并可明显地抑制杂草的再生，没有发现对农作物有什么不良反应。
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